2.2 Категории - это возможность выбрать какие товары категорий выгружать в фид. В списке есть кнопки включения категорий. Справа от названия категории есть плюсик. При клике по нему идет раскрытие списка подкатегорий. Если плюсика нет в категории - нет подкатегорий.
Выбирать надо всегда конечные категории. Категории выше по иерархии будут в фиде в блоке categories.
Логика выборки из базы в том что если в товаре задана категория (на вкладке Связи - Показывать в категориях) и эта категория выбрана в UniXML то товар попадает в фид. Также есть настройка привязка к главной категории. Если там будет стоять привязываться то будут попадать в фид товары выбранных категорий у которых эта категория выбрана как главная.
В списке категорий есть внизу есть две кнопки Убрать все и Выбрать все. Действия кнопок распространяется на тот список под которым они выведены. Если в списке есть подкатегории то и они будут выбраны при клике на кнопку выбора или снятия.
Если необходимо выгружать все категории, можно не выбирать их все, смысла в этом нет. Если категории не выбраны - выгружаются все, без фильтрации по категориям.
Обратите внимание, если в товаре не присвоена ни одна категория - в выгрузку такой товар не попадет. В любом случае какая-то категория должна быть присвоена.
В параметрах системы UniXML настройка находится в $data['categories']